Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPN1P18031 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN1P18031 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPN1P18031 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms