Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN2P17655 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN2P17655 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms