Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD44P16070 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD44P16070 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD44P16070 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD44P16070 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD44P16070 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD44P16070 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD44P16070 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD44P16070 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD44P16070 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms