Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms