Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODC1P11926 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODC1P11926 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODC1P11926 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODC1P11926 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODC1P11926 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ODC1P11926 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ODC1P11926 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ODC1P11926 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ODC1P11926 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ODC1P11926 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms