Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHRNB1P11230 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms