Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMC1P11047 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms