Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHGAP10645 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHGAP10645 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHGAP10645 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHGAP10645 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHGAP10645 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHGAP10645 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHGAP10645 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHGAP10645 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHGAP10645 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHGAP10645 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHGAP10645 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHGAP10645 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHGAP10645 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHGAP10645 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHGAP10645 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHGAP10645 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHGAP10645 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHGAP10645 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHGAP10645 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHGAP10645 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHGAP10645 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms