Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALM3P0DP25 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALM3P0DP25 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms