Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C4AP0C0L4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4AP0C0L4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms