Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
PKHD1P08F94 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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