Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGAP02671 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGAP02671 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGAP02671 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGAP02671 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGAP02671 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FGAP02671 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGAP02671 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGAP02671 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms