Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL2A1P02458 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL2A1P02458 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms