Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFDP00746 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFDP00746 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFDP00746 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFDP00746 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms