Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NSD2O96028 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NSD2O96028 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSD2O96028 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSD2O96028 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSD2O96028 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSD2O96028 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSD2O96028 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSD2O96028 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NSD2O96028 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NSD2O96028 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NSD2O96028 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSD2O96028 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms