Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms