Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24BO95487 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24BO95487 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms