Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAPGEF3O95398 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms