Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8BO95263 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8BO95263 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms