Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLIT2O94813 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLIT2O94813 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms