Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL5O76039 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL5O76039 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms