Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA4O75676 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA4O75676 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms