Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGSF3O75054 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IGSF3O75054 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms