Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF2O60811 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms