Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CUBNO60494 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms