Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCA5O60264 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCA5O60264 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms