Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX16O60231 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DHX16O60231 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX16O60231 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms