Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms