Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms