Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTATSF1O43719 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTATSF1O43719 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms