Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTIFO43310 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTIFO43310 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTIFO43310 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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