Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRGAP3O43295 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SRGAP3O43295 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms