Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLOCKO15516 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms