Protein–RNA interactions for Protein: O15438

ABCC3, Canalicular multispecific organic anion transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3O15438 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC3O15438 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC3O15438 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms