Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF5O00463 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms