Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GOLIM4O00461 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GOLIM4O00461 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms