Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVV-2B6SEH9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-2B6SEH9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms