Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A8MVJ9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A8MVJ9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A8MVJ9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A8MVJ9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
A8MVJ9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A8MVJ9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A8MVJ9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A8MVJ9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
A8MVJ9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A8MVJ9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A8MVJ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A8MVJ9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
A8MVJ9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A8MVJ9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A8MVJ9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms