Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM4A7MD48 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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