Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF7

TMEM88B, Transmembrane protein 88B, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88BA6NKF7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM88BA6NKF7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM88BA6NKF7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms