Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF316A6NFI3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms