Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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