Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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