Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SEMA3BQ13214 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEMA3BQ13214 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms