Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USF2Q15853 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
USF2Q15853 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
USF2Q15853 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USF2Q15853 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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