Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TCOF1Q13428 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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TCOF1Q13428 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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TCOF1Q13428 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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TCOF1Q13428 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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TCOF1Q13428 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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TCOF1Q13428 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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TCOF1Q13428 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TCOF1Q13428 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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