Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms