Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ACACAQ13085 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms