Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ERV3-1Q14264 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERV3-1Q14264 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERV3-1Q14264 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ERV3-1Q14264 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ERV3-1Q14264 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERV3-1Q14264 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERV3-1Q14264 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ERV3-1Q14264 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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ERV3-1Q14264 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ERV3-1Q14264 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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