Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SF3B2Q13435 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SF3B2Q13435 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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